微生物肥功效独特，但非“灵丹妙药”现在社会上对微生物肥料的看法，存在两个极端。一种看法认为它肥效高，把它当万能肥料，甚至认为可完全代替化肥;另一种看法，则认为它根本不能算作肥料，或者仅作为配肥使用。其实这两种看法都存在片面性。

　　首先，微生物肥料与富含氮磷钾的化学肥料不同，微生物肥料是通过微生物的生命活动直接或间接地促进作物生长，抗病虫害，改善作物品质，而不仅仅以增加作物的产量为惟一标准。

　　其次，从目前的研究和试验结果来看，微生物肥料不能完全取代化肥，不过研究证实，在同样有效产量构成的情况下，使用微生物肥料可不同程度地减少化肥使用量。

　　从微生物肥料的管理层面而言，目前将其分为：农用微生物菌剂、复合微生物肥料和生物有机肥三类。

　　1、微生物菌剂是指目标微生物(有效菌)经过工业化生产扩繁后，利用多孔的物质作为吸附剂(如草炭、蛭石)，吸附菌体的发酵液加工制成的活菌制剂。这种菌剂用于拌种或蘸根，具有直接或间接改良土壤、恢复地力、维持根际微生物区系平衡和降解有毒害物质等作用。

　　2、复合微生物肥料是指特定微生物与营养物质复合而成，能提供、保持或改善植物营养，提高农产品产量或改善农产品品质的活体微生物制品。

　　根据营养物质的不同，可分为：微生物和有机物复合、微生物和有机物质及无机元素复合。

　　如根据作用机理则可分为：以营养为主、以抗病为主、以降解农药为主，也可多种作用同时兼有。

　　如按其制品中特定的微生物种类，复合微生物肥料还可这样分类:细菌肥料(根瘤菌肥、固氮、解磷、解钾肥)、放线菌肥(抗生肥料)、真菌类肥料(菌根真菌、霉菌肥料、酵母肥料)、光合细菌肥料。

　　3、生物有机肥则是指特定功能微生物与主要以动植物残体(如畜禽粪便、农作物秸秆等)为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的肥料，兼具微生物肥料和有机肥双重效应。生物有机肥，分为土家肥(堆肥、沼渣)和商品生物有机肥两种。后者为商品化生产后的生物有机肥，即农家肥商品化生产后的产物。有机肥和微生物菌剂，每克含菌量大于2000万功能菌。

　　微生物肥料的剂型有液体和固体两种，不论哪一种菌型都要对微生物有保护作用，使之尽量长时间地生存，顺利地进入土壤繁殖。微生物肥料中的有益微生物进行生命活动时需要能量和养分，进入土壤后，当能源物质和营养(如水分、温度、氧气、酸碱度等)供应充足时，其所含有的有益微生物便大量繁殖和旺盛代谢，从而发挥其效果。反之，则无效果或效果不明显。

　　生物有机肥与生物菌肥价格区别比较明显。前者价格便宜，每吨在1000元左右，后者价格昂贵，每吨上万元。

　　另外，生物有机肥的有机质本身就是功能菌生活的环境，施入土壤后容易存活，而生物菌肥的功能菌对有些土壤环境可能并不适合。

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